Four Genotyping Schemes for Phylogenetic Analysis of Pseudomonas aeruginosa: Comparison of Their Congruence with Multi-Locus Sequence Typing

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Correction: Four Genotyping Schemes for Phylogenetic Analysis of Pseudomonas aeruginosa: Comparison of Their Congruence with Multi-Locus Sequence Typing

Several molecular typing schemes have been proposed to differentiate among isolates and clonal groups, and hence establish epidemiological or phylogenetic links. It has been widely accepted that multi-locus sequence typing (MLST) is the gold standard for phylogenetic typing/long-term epidemiological surveillance, but other recently described methods may be easier to carry out, especially in set...

متن کامل

Population genetic analysis of Pseudomonas aeruginosa using multilocus sequence typing.

To study the population genetic structure of Pseudomonas aeruginosa, we developed a multilocus sequence typing scheme. The sequences of internal fragments of seven housekeeping genes were obtained for 34 P. aeruginosa isolates from patients hospitalized in five different European cities. Twenty-six different allelic profiles were identified. The mean allelic diversity was 0.854 (range: 0.606-0....

متن کامل

Phylogenetic analysis of Clostridium botulinum type A by multi-locus sequence typing.

The genus Clostridium comprises a heterogeneous group of organisms for which the phylogeny and evolutionary relationships are poorly understood. The elucidation of these evolutionary relationships necessitates the use of experimental methods that can distinguish Clostridium lineages that are time and cost effective, and can be accurately and reproducibly employed in different laboratories. Mult...

متن کامل

investigation of single-user and multi-user detection methods in mc-cdma systems and comparison of their performances

در این پایان نامه به بررسی روش های آشکارسازی در سیستم های mc-cdma می پردازیم. با توجه به ماهیت آشکارسازی در این سیستم ها، تکنیک های آشکارسازی را می توان به دو دسته ی اصلی تقسیم نمود: آشکارسازی سیگنال ارسالی یک کاربر مطلوب بدون در نظر گرفتن اطلاعاتی در مورد سایر کاربران تداخل کننده که از آن ها به عنوان آشکارساز های تک کاربره یاد می شود و همچنین آشکارسازی سیگنال ارسالی همه ی کاربران فعال موجود در...

Multilocus sequence typing and phylogenetic analyses of Pseudomonas aeruginosa Isolates from the ocean.

Recent isolation of Pseudomonas aeruginosa strains from the open ocean and subsequent pulsed-field gel electrophoresis analyses indicate that these strains have a unique genotype (N. H. Khan, Y. Ishii, N. Kimata-Kino, H. Esaki, T. Nishino, M. Nishimura, and K. Kogure, Microb. Ecol. 53:173-186, 2007). We hypothesized that ocean P. aeruginosa strains have a unique phylogenetic position relative t...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: PLoS ONE

سال: 2013

ISSN: 1932-6203

DOI: 10.1371/journal.pone.0082069